Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa9P09631 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa9P09631 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxa9P09631 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa9P09631 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa9P09631 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa9P09631 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa9P09631 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa9P09631 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms