Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt18P05784 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Krt18P05784 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt18P05784 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt18P05784 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt18P05784 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt18P05784 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt18P05784 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt18P05784 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt18P05784 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt18P05784 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt18P05784 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt18P05784 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt18P05784 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt18P05784 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt18P05784 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt18P05784 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt18P05784 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt18P05784 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt18P05784 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt18P05784 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt18P05784 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms