Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01853 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01853 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01853 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01853 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01853 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01853 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01853 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01853 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01853 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01853 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01853 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01853 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01853 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01853 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01853 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01853 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01853 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01853 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01853 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01853 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01853 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01853 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01853 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01853 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01853 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01853 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01853 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01853 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01853 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01853 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01853 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01853 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01853 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01853 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01853 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01853 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01853 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01853 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01853 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01853 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01853 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01853 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01853 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01853 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01853 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01853 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01853 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01853 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01853 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01853 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01853 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01853 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01853 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01853 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01853 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01853 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01853 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01853 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01853 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01853 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01853 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01853 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01853 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01853 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01853 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01853 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01853 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01853 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01853 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01853 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01853 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01853 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01853 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01853 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01853 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01853 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01853 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01853 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01853 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01853 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01853 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01853 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01853 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01853 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01853 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01853 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01853 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01853 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms