Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01741 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01741 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01741 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01741 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01741 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01741 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01741 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01741 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01741 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01741 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01741 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01741 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01741 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01741 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01741 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01741 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01741 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01741 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01741 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01741 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01741 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01741 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01741 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01741 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01741 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01741 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01741 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01741 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01741 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01741 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01741 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01741 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01741 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01741 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01741 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01741 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01741 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01741 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01741 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01741 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01741 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01741 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01741 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01741 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01741 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01741 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01741 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01741 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01741 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01741 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01741 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01741 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01741 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01741 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01741 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01741 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01741 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01741 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01741 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01741 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01741 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01741 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01741 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01741 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01741 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01741 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01741 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01741 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01741 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01741 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01741 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01741 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01741 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01741 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01741 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01741 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms