Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hcn3O88705 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn3O88705 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn3O88705 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hcn3O88705 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn3O88705 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn3O88705 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms