Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
BlmO88700 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
BlmO88700 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
BlmO88700 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
BlmO88700 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BlmO88700 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BlmO88700 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
BlmO88700 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BlmO88700 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BlmO88700 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
BlmO88700 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
BlmO88700 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
BlmO88700 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BlmO88700 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
BlmO88700 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
BlmO88700 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BlmO88700 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
BlmO88700 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
BlmO88700 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
BlmO88700 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
BlmO88700 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BlmO88700 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
BlmO88700 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BlmO88700 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BlmO88700 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BlmO88700 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
BlmO88700 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
BlmO88700 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BlmO88700 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
BlmO88700 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
BlmO88700 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BlmO88700 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BlmO88700 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BlmO88700 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BlmO88700 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
BlmO88700 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BlmO88700 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
BlmO88700 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BlmO88700 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
BlmO88700 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BlmO88700 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BlmO88700 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BlmO88700 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BlmO88700 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BlmO88700 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
BlmO88700 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
BlmO88700 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BlmO88700 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
BlmO88700 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
BlmO88700 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
BlmO88700 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BlmO88700 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BlmO88700 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BlmO88700 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BlmO88700 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BlmO88700 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BlmO88700 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BlmO88700 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BlmO88700 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BlmO88700 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BlmO88700 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BlmO88700 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BlmO88700 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BlmO88700 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BlmO88700 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BlmO88700 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BlmO88700 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
BlmO88700 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
BlmO88700 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BlmO88700 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
BlmO88700 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BlmO88700 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BlmO88700 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BlmO88700 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BlmO88700 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BlmO88700 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BlmO88700 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BlmO88700 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BlmO88700 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
BlmO88700 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BlmO88700 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BlmO88700 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
BlmO88700 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BlmO88700 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BlmO88700 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BlmO88700 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BlmO88700 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
BlmO88700 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BlmO88700 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BlmO88700 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BlmO88700 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BlmO88700 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
BlmO88700 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
BlmO88700 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BlmO88700 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BlmO88700 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BlmO88700 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BlmO88700 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BlmO88700 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
BlmO88700 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms