Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RradO88667 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RradO88667 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RradO88667 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RradO88667 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RradO88667 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RradO88667 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RradO88667 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RradO88667 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RradO88667 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RradO88667 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RradO88667 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RradO88667 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RradO88667 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RradO88667 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RradO88667 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RradO88667 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RradO88667 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RradO88667 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RradO88667 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RradO88667 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RradO88667 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RradO88667 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RradO88667 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RradO88667 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RradO88667 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RradO88667 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RradO88667 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RradO88667 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RradO88667 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RradO88667 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RradO88667 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RradO88667 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RradO88667 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RradO88667 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RradO88667 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RradO88667 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RradO88667 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RradO88667 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RradO88667 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RradO88667 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RradO88667 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RradO88667 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RradO88667 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RradO88667 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RradO88667 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RradO88667 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RradO88667 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RradO88667 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RradO88667 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RradO88667 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RradO88667 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RradO88667 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RradO88667 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RradO88667 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RradO88667 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RradO88667 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RradO88667 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RradO88667 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RradO88667 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RradO88667 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RradO88667 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RradO88667 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RradO88667 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RradO88667 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RradO88667 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RradO88667 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RradO88667 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RradO88667 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RradO88667 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RradO88667 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RradO88667 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RradO88667 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RradO88667 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RradO88667 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RradO88667 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RradO88667 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RradO88667 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RradO88667 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RradO88667 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RradO88667 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RradO88667 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RradO88667 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RradO88667 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RradO88667 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RradO88667 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RradO88667 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RradO88667 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RradO88667 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms