Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn2O88552 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cldn2O88552 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn2O88552 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cldn2O88552 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cldn2O88552 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn2O88552 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cldn2O88552 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn2O88552 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cldn2O88552 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cldn2O88552 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms