Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dync1i1O88485 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dync1i1O88485 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dync1i1O88485 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Dync1i1O88485 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dync1i1O88485 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dync1i1O88485 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dync1i1O88485 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms