Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma3O70435 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma3O70435 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma3O70435 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Psma3O70435 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psma3O70435 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma3O70435 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma3O70435 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma3O70435 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma3O70435 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psma3O70435 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma3O70435 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psma3O70435 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psma3O70435 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma3O70435 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psma3O70435 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma3O70435 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psma3O70435 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psma3O70435 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms