Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Supt5hO55201 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Supt5hO55201 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Supt5hO55201 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Supt5hO55201 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Supt5hO55201 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Supt5hO55201 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Supt5hO55201 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Supt5hO55201 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Supt5hO55201 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Supt5hO55201 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Supt5hO55201 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Supt5hO55201 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Supt5hO55201 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Supt5hO55201 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Supt5hO55201 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Supt5hO55201 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt5hO55201 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Supt5hO55201 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt5hO55201 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms