Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole2O54956 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pole2O54956 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pole2O54956 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pole2O54956 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole2O54956 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pole2O54956 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pole2O54956 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pole2O54956 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pole2O54956 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pole2O54956 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole2O54956 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pole2O54956 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pole2O54956 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pole2O54956 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole2O54956 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pole2O54956 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pole2O54956 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms