Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Klf9O35739 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Klf9O35739 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Klf9O35739 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Klf9O35739 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Klf9O35739 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Klf9O35739 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,36■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Klf9O35739 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf9O35739 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,28■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Klf9O35739 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Klf9O35739 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,21■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Klf9O35739 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Klf9O35739 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Klf9O35739 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Klf9O35739 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms