Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a6O35544 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc1a6O35544 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc1a6O35544 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc1a6O35544 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc1a6O35544 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc1a6O35544 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc1a6O35544 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms