Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt1O35449 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prrt1O35449 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrt1O35449 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prrt1O35449 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prrt1O35449 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt1O35449 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt1O35449 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prrt1O35449 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms