Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppt2O35448 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppt2O35448 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppt2O35448 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppt2O35448 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppt2O35448 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppt2O35448 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppt2O35448 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppt2O35448 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppt2O35448 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppt2O35448 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppt2O35448 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms