Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh2d1bO35324 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh2d1bO35324 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh2d1bO35324 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh2d1bO35324 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh2d1bO35324 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2d1bO35324 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2d1bO35324 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms