Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cx3cl1O35188 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cx3cl1O35188 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cx3cl1O35188 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cx3cl1O35188 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cx3cl1O35188 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cx3cl1O35188 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cx3cl1O35188 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cx3cl1O35188 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cx3cl1O35188 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cx3cl1O35188 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms