Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
PrkcshO08795 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
PrkcshO08795 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
PrkcshO08795 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
PrkcshO08795 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
PrkcshO08795 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
PrkcshO08795 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
PrkcshO08795 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
PrkcshO08795 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms