Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cacna2d1O08532 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna2d1O08532 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna2d1O08532 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna2d1O08532 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna2d1O08532 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d1O08532 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms