Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn2O08529 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn2O08529 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn2O08529 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Capn2O08529 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Capn2O08529 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn2O08529 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Capn2O08529 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn2O08529 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn2O08529 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn2O08529 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capn2O08529 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Capn2O08529 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Capn2O08529 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Capn2O08529 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Capn2O08529 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn2O08529 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Capn2O08529 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Capn2O08529 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms