Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm8653K9J7G2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm8653K9J7G2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm8653K9J7G2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8653K9J7G2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8653K9J7G2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8653K9J7G2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.6 ms