Protein–RNA interactions for Protein: K7N6W5

Gm17019, Predicted gene 17019, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17019K7N6W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17019K7N6W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm17019K7N6W5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm17019K7N6W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17019K7N6W5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17019K7N6W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm17019K7N6W5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms