Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
HrcG5E8J6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
HrcG5E8J6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HrcG5E8J6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
HrcG5E8J6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
HrcG5E8J6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HrcG5E8J6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HrcG5E8J6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HrcG5E8J6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HrcG5E8J6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
HrcG5E8J6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
HrcG5E8J6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HrcG5E8J6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
HrcG5E8J6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HrcG5E8J6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HrcG5E8J6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
HrcG5E8J6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms