Protein–RNA interactions for Protein: G5E845

Kcnk16, MCG5959, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk16G5E845 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk16G5E845 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnk16G5E845 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk16G5E845 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnk16G5E845 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnk16G5E845 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnk16G5E845 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnk16G5E845 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnk16G5E845 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnk16G5E845 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnk16G5E845 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk16G5E845 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms