Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf148G3X9R7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf148G3X9R7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf148G3X9R7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf148G3X9R7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf148G3X9R7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf148G3X9R7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms