Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Nolc1E9Q5C9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nolc1E9Q5C9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nolc1E9Q5C9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Nolc1E9Q5C9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nolc1E9Q5C9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nolc1E9Q5C9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nolc1E9Q5C9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nolc1E9Q5C9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nolc1E9Q5C9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms