Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pgbd1E9Q492 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgbd1E9Q492 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pgbd1E9Q492 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgbd1E9Q492 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pgbd1E9Q492 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pgbd1E9Q492 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pgbd1E9Q492 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms