Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tarbp1E9Q368 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Tarbp1E9Q368 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Tarbp1E9Q368 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Tarbp1E9Q368 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Tarbp1E9Q368 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Tarbp1E9Q368 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Tarbp1E9Q368 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Tarbp1E9Q368 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
Tarbp1E9Q368 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tarbp1E9Q368 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Tarbp1E9Q368 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Tarbp1E9Q368 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Tarbp1E9Q368 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms