Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp558E9Q1J0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp558E9Q1J0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp558E9Q1J0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp558E9Q1J0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp558E9Q1J0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp558E9Q1J0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms