Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3298E9PW80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3298E9PW80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3298E9PW80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3298E9PW80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3298E9PW80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3298E9PW80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3298E9PW80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3298E9PW80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3298E9PW80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms