Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931429L15RikE9PVU2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931429L15RikE9PVU2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931429L15RikE9PVU2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931429L15RikE9PVU2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931429L15RikE9PVU2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931429L15RikE9PVU2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931429L15RikE9PVU2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms