Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm9008E9PVG0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm9008E9PVG0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9008E9PVG0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm9008E9PVG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9008E9PVG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms