Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Syde2E9PUP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Syde2E9PUP1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Syde2E9PUP1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31,01■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,56
Syde2E9PUP1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Syde2E9PUP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Syde2E9PUP1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Syde2E9PUP1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Syde2E9PUP1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms