Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1500009C09RikD3YYW9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
1500009C09RikD3YYW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1500009C09RikD3YYW9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
1500009C09RikD3YYW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1500009C09RikD3YYW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms