Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CatipB9EKE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CatipB9EKE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CatipB9EKE5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CatipB9EKE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CatipB9EKE5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CatipB9EKE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CatipB9EKE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CatipB9EKE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CatipB9EKE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CatipB9EKE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CatipB9EKE5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CatipB9EKE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CatipB9EKE5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CatipB9EKE5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CatipB9EKE5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CatipB9EKE5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CatipB9EKE5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms