Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cspp1B2RX88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cspp1B2RX88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cspp1B2RX88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cspp1B2RX88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cspp1B2RX88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cspp1B2RX88 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms