Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usf3B2RUQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usf3B2RUQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usf3B2RUQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usf3B2RUQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usf3B2RUQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms