Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Uhrf1bp1B2KF50 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Uhrf1bp1B2KF50 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Uhrf1bp1B2KF50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Uhrf1bp1B2KF50 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Uhrf1bp1B2KF50 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Uhrf1bp1B2KF50 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Uhrf1bp1B2KF50 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.8 ms