Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CK137956B1AYM9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CK137956B1AYM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CK137956B1AYM9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CK137956B1AYM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CK137956B1AYM9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CK137956B1AYM9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms