Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf25B1AWN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfrsf25B1AWN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf25B1AWN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf25B1AWN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfrsf25B1AWN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfrsf25B1AWN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms