Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al2bA9Z055 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al2bA9Z055 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al2bA9Z055 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al2bA9Z055 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al2bA9Z055 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms