Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fibcd1A2AV25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fibcd1A2AV25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fibcd1A2AV25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fibcd1A2AV25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fibcd1A2AV25 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fibcd1A2AV25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms