Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam43bA2AM80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam43bA2AM80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam43bA2AM80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam43bA2AM80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fam43bA2AM80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam43bA2AM80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam43bA2AM80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam43bA2AM80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam43bA2AM80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam43bA2AM80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam43bA2AM80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam43bA2AM80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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