Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo47A2A6H3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo47A2A6H3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo47A2A6H3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo47A2A6H3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Fbxo47A2A6H3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fbxo47A2A6H3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo47A2A6H3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo47A2A6H3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms