Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pgap3A2A559 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pgap3A2A559 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pgap3A2A559 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pgap3A2A559 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pgap3A2A559 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pgap3A2A559 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pgap3A2A559 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pgap3A2A559 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pgap3A2A559 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pgap3A2A559 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pgap3A2A559 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pgap3A2A559 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms