Protein–RNA interactions for Protein: A1A546

Isx, Intestine-specific homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IsxA1A546 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IsxA1A546 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IsxA1A546 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IsxA1A546 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IsxA1A546 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IsxA1A546 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IsxA1A546 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IsxA1A546 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IsxA1A546 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IsxA1A546 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IsxA1A546 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IsxA1A546 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IsxA1A546 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IsxA1A546 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IsxA1A546 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms