Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28576A0A087WRP6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28576A0A087WRP6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28576A0A087WRP6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28576A0A087WRP6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm28576A0A087WRP6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28576A0A087WRP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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