Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1DQ9Y2S0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1DQ9Y2S0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms