Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms